Johan Rachmat Santosa memiliki pengalaman luas dalam mengelola program penguatan ketangguhan bencana masyarakat, pengembangan program-program pemberdayaan masyarakat, penguatan jejaring dan manajemen organisasi dalam 15 tahun terakhir dengan berbagai lembaga seperti Global Communities (sebelumnya Community, Habitat, and Finance International), International Organization for Migration (IOM), Chemonics US, Cordaid Netherland melalui Caritas Indonesia.

Johan berpengalaman memberikan fasilitasi teknis dalam pelaksanaan kajian risiko bencana dan penyusunan Rencana Aksi  Ketangguhan Masyarakat (RCAP), penyusunan Agenda Bersama Kolaborasi Multi-Pemangku Kepentingan,  perencanaan dan pelaksanaan kegiatan advokasi kebijakan dan merancang strategi komunikasi. Sejak tahun 2020 hingga saat ini, Johan adalah anggota Forum DAS Nasional Indonesia di bawah Direktorat Perencanaan Pengelolaan dan Pengawasan DAS Kementerian Kehutanan RI yang berfokus pada langkah-langkah Adaptasi Perubahan Iklim dan Pengurangan Risiko Bencana di daerah aliran sungai.